Le Laboratoire de biooptique et d’écologie microbienne soutient les travaux de recherche de l'équipe de la professeure Isabelle Laurion, lesquels portent sur les effets des changements climatiques sur la dynamique de mélange et la transparence de l’eau en milieu lacustre, et leur interaction avec le réseau alimentaire microbien (bactéries, phytoplancton, microzooplancton). Les équipements du laboratoire sont aussi mis à contribution dans l'étude des conséquences de la fonte du pergélisol sur le cycle du carbone en milieu nordique. Ils permettent entre autres de caractériser et dénombrer les petites particules (bactéries, picophytoplancton; cytométrie en flux), de faire le suivi in situ des microorganismes possédant une fluorescence naturelle (cyanobactéries, chlorophytes, diatomées ou dinoflagellés, cryptophytes; fluoroprobe), de décrire leur morphométrie et leur taxonomie (microscopie inverse par épifluorescence) et d’étudier leur physiologie (fluorimétrie PAM). Il serait éventuellement possible de combiner à ces instruments (microscope et cytomètre) l’utilisation de sondes moléculaires fluorescentes afin d’améliorer la taxonomie des procaryotes ou d’étudier certains aspects physiologiques.

Infrastructure

Principaux équipements disponibles :

• Cytomètre en flux (FACSCalibur, BD) permettant d’analyser les propriétés optiques et physiologiques des organismes microbiens (ex. ADN, pigments, abondance);
• Fluoroprobe (BBE Moldaenke) permettant de faire des profils verticaux des assemblages planctoniques in situ dans les milieux aquatiques (ex. migration verticale du phytoplancton, localisation rapide des cyanobactéries);
• Microscope inverse à épifluorescence (Axiovert, Zeiss) permettant d’identifier et de caractériser les espèces planctoniques (ex. fluorescence naturelle du phytoplancton et marqueurs d’ADN). Ce sont des instruments obtenus grâce à la Fondation canadienne pour l'innovation (FCI);
• Fluorimètre PAM (Phyto-PAM, Walz) permettant de déterminer les caractéristiques physiologiques des organismes photosynthétiques (ex. rendement quantique, photoinhibition);
• Photomètre (MicroPro, Satlantic) permettant de faire des profils verticaux d’éclairement à 8 longueurs d’onde dans le visible et les UV (ex. coefficients d’extinction de la lumière);
• Profileur physicochimique (YSI) permettant de faire des profils verticaux de la température, du pH, de l’oxygène dissous et de la conductivité;
• Système de mesure en continu des gaz dissous dans l’eau (prototype pour CO₂, CH₄ et O₂) permettant d’estimer l’emission de gaz à effet de serre par les systèmes aquatiques;
• système de mesure du CO₂ dans l’air (EGM-4, PP-Systems) permettant de mesurer les flux de CO₂ à l’interface eau-air des lacs et des mares.

Services

Le laboratoire est à la disposition des professeurs, étudiants et professionnels du Centre Eau Terre Environnement de l’INRS pour leurs projets de recherche. Il est également possible d’utiliser les ressources du laboratoire, et notre expertise, dans le cadre de collaborations externes ou de contrats de R&D. Conactez-nous pour en savoir plus.

Personnes ressources

Isabelle Laurion

Responsable scientifique

Centre Eau Terre Environnement

490, rue de la Couronne
Québec (Québec) G1K 9A9

Canada

Téléphone : 418 654-2694
Télécopie : 418 654-2600
Courriel : isabelle.laurion@ete.inrs.ca

Carole Parent

Agente de la valorisation

Téléphone : 418 654-2531
Télécopie : 418 654-2600
Courriel : carole.parent@ete.inrs.ca